Além das aulas de Educação Física, presentes no currículo de todos os níveis de ensino, o Colégio Farroupilha oferece, a estudantes do 3º ano do Ensino Fundamental a 3ª série do Ensino Médio, a possibilidade de participar de equipes esportivas em cinco modalidades: Basquete, Futsal, Futebol de Campo, Handebol e Voleibol. As equipes têm treinos uma, duas ou três vezes na semana, de acordo com a modalidade e a faixa etária, e participam de competições regionais, nacionais e internacionais.